Отдельная благодарность Даниил Никитин за предоставленную возможность. В прошлом году наши студенты и коллеги заняли второе место на хакатоне по эволюционной биоинформатике, который проходил в Сеченовском Университете. По результатам работы Карина Пац, Анастасия Мурзина, Антон Замятин и Никита Колосов совместно с коллегами подготовили статью о влиянии ретротранспозонов, связанных с участками гистонной модификации H3K4me1, на эволюцию энхансеров генов.
В статье были рассмотрены геномные данные, содержащие позиции ретроэлементов и энхансерных участков, которые характеризуются гистонной модификацией H3K4me1. Было подсчитано, насколько насыщенными являются отдельные энхансеры, которые были проранжированы с учетом этой характеристики. Также авторы проаннотировали гены, к которым относятся энхансеры. Предполагается, что насыщенность области генома ретроэлементами означает его быструю скорость эволюции. Таким образом, определив наиболее и и наименее насыщенные рэтроэлементами гены, в статье оценивается их подверженность быстрой эволюции.
Результаты исследования опубликованы в журнале Cells.